Ulteriori differenze tra i conti puri e quelle multicanale sono rilevabili anche nelle modalità mediante le quali sono tariffati i prelievi tramite bancomat. Tutti i servizi di home banking prevedono che le operazioni effettuate presso l'Atm della banca emittente siano gratuite. Mentre però per quelli puri non è mai prevista alcuna spesa, indipendentemente dalla banca a cui appartiene l'Atm utilizzato, per quelli multicanale possono essere addebitate delle commissioni nel momento in cui il prelievo viene effettuato presso lo sportello di un istituto che non sia quello della banca emittente o del gruppo bancario a cui quest'ultima fa riferimento: Unicredit, Intesa SanPaolo e il Monte dei Paschi di Siena stabiliscono in questo caso un balzello di 2 euro.
Riguardo poi all'invio di bonifici in Italia, i servizi di home banking non prevedono alcun costo per quelli ordinati on-line (nel caso però in cui ci si rechi in filiale si deve pagare sempre una commissione per eseguire questa operazione).
"Tecnicamente" il Monte dei Paschi prevederebbe una commissione per l'invio di bonifici on-line: la banca offre però per ogni mese un numero di bonifici a costo zero talmente elevato (ben trenta) da rendere, nella pratica tale operazione sempre gratuita. Indifferentemente dal tipo di conto proposto, molte banche hanno poi mantenuto l'abitudine di far pagare il carnet degli assegni. http://www.contocorrentearancio.it offre il primo libretto gratuitamente, ma quelli successivi costano 5 euro l'uno. Poste Italiane ha deciso che il ritiro degli assegni sia gratuito fino a fine giugno, dopo questa data ciascun libretto avrà un prezzo di 3 euro. Il Monte dei Paschi di Siena e BNL-BNP Paribas fanno pagare ciascun assegno, rispettivamente, 0,20 e 0,10 euro. Tutte le altre banche offrono il carnet gratuitamente, ma se si desidera ricevere il libretto a casa è il caso di ricordare che si dovranno sempre pagare le relative spese di spedizione. Infine, a tutti coloro che hanno un conto on-line (o semplicemente uno multicanale) può convenire di rinunciare all'invio dell'estratto conto mensile cartaceo, risparmiando così anche il denaro (da 1 a 2 euro) che si paga periodicamente per la spedizione di tali messaggi. Quando infatti si utilizza un conto bancario tradizionale è certamente utile ricevere a casa il consuntivo cartaceo, in modo tale da poter monitorare entrate e uscite senza doversi recare in filiale. Se però si attiva un servizio di home banking, si può accedere al proprio account in ogni momento per visionare l'estratto conto e dare un'occhiata alle ultime ricevute contabili. Inoltre, la maggioranza dei servizi di home banking prevede l'abilitazione gratuita per i servizi di "SMS Alert" che consentono di ricevere a richiesta (o automaticamente) un avviso per ogni addebito o accredito effettuato sul conto. Una volta attivato il servizio ricordate che ogni messaggino inviato o ricevuto è a pagamento.
I primi servono per richiedere un aggiornamento sul proprio conto corrente e sono tariffati secondo il piano tariffario stipulato con il proprio operatore di telefonia mobile. I secondi sono inviati a seguito della richiesta (o automaticamente) sulla base dei parametri decisi dall'utente (che per esempio potrebbe voler ricevere una notifica via SMS solo per ogni addebito superiore a una certa soglia) e hanno un prezzo fissato dalla banca presso cui si è aperto il conto.